在北京私人公司名下车牌的转让并非只有一种方法，但股权转让是一种常见且合规的方式来进行。以下是通过股权转让操作公司名下车牌办理转让的一般步骤：

1. 确定转让意向：首先，确认卖方（转让方）与买方（受让方）之间关于车牌及公司股权转让的意向，并商定转让价格和其他条件。

2. 尽职调查：买方应对目标公司进行全面的尽职调查，包括财务状况、税务记录、法律诉讼、资产（特别是车牌）以及任何潜在的债务或责任。

3. 签订转让协议：双方应签订股权转让协议，明确转让的股权比例、转让价格、支付方式、转让条件、双方权利与义务等条款。同时，协议中也应明确车牌随公司资产一并转让的条款。

4. 法律公正：为确保协议的法律效力，建议到律师事务所进行转让协议的公正。

5. 办理转让手续：

   - 工商变更：携带相关材料，如营业执照、公章、变更申请书、委托书、股东会决议、股权转让协议、新股东的身份证件等，前往当地工商局办理公司股东变更手续。

   - 质监局与税务局变更：根据需要，还需到质监局进行组织机构代码证的变更，以及到税务局进行税务登记证的变更。

   - 车管所变更：完成上述手续后，需到车辆管理所（车管所）办理车辆所有人变更，确保车牌随公司资产一并合法转移到新股东名下。

6. 支付转让款项：按照协议约定，买方向卖方支付股权转让款项。

7. 交接与公告：完成所有变更手续后，双方进行公司资料、资产及相关权利的交接，并按要求进行企业变更的公告。

请注意，以上流程为一般性指导，具体操作时还需依据Zui新的政策法规及地方要求进行，可能还涉及其他细节和特定条件。在实际操作前，咨询专业律师或会计师的建议是非常必要的。